César Vayssié est diplômé de l’école nationale supérieure des beaux-arts de Dijon. Dans les années 90, il est l’auteur de plusieurs oeuvres vidéo dont Les saisons : Les Quatre saisons, La cinquième saison... Cette série est montrée au Centre Georges Pompidou (Ici Paris Europe), au Musée d’Art Moderne de la Ville de Paris et au National Film Archives de New York. Il produit et réalise une série d’oeuvres documentaires sur des artistes contemporains (Conscience, Rire Jaune...). Il travaille aux côtés d’Eric Colliard et Angèle Legrand dans le cadre de Nouvelles Scènes à Dijon. En parallèle, il produit et réalise des films expérimentaux de fiction (Un jour son prince, It’s wonderful...). Il commence une collaboration avec Odile Duboc et Françoise Michel. Il est assistant de Philippe Decouflé. De septembre 1996 à septembre 1997, il est pensionnaire à la Villa Médicis à Rome où il rencontre l’écrivain Yves Pagès avec qui il écrit le scénario Elvis de Médicis. Le film est tourné à Rome en août 1997 et sa finalisation se poursuit jusqu’en 1999. En 2000, il réalise Les disparates, film d’après une chorégraphie originale de Boris Charmatz et Dimitri Chamblas. Il s’en suit une longue collaboration avec Boris Charmatz (Education, héâtre-élévision, Bocal, Tarkos Training, Three collective gestures, Levée). Jusqu’en 2010, il partage son activité entre des réalisations d’œuvres de fictions (Aujourd’hui Madame, Phénix), des productions expérimentales (American Forsythe, The circle X, The playlist...) , des collaborations avec l’art contemporain ou le spectacle vivant. Il rencontre Philippe Quesne en 2010 et intègre Vivarium studio. Il est interprète dans les créations Big Bang et L’effet de Serge. En 2012, il collabore à la série Bivouac et réalise avec Philippe Quesne le film Garden Party. En août 2013 il tourne le film Levée , avec Boris Charmatz (une étape de montage est présentée au MoMA à New-York en octobre 2013 dans le cadre de Three Collective Gestures). En novembre 2013, il collabore à Bivouac de Philippe Quesne (Performa, New-York). Le film Levée sera présenté à la Ruhrtriennale 2014 au Folkwang Museum.